一篇看懂!神經(jīng)系統(tǒng)AAV血清型怎么選擇(值得收藏)
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AAV血清型的選擇
有沒有來自靈魂的拷問:血清型那么多,我應(yīng)該選哪個(gè)?
本期我們將著重介紹神經(jīng)方向不同研究中AAV血清型的選擇。
AAV血清型即AAV的抗血清類型,目前已發(fā)現(xiàn)數(shù)十種不同衣殼蛋白的AAV,不同的衣殼蛋白(Cap)或AAV血清型提供了多樣性的組織侵染能力的選擇,并且為避開基因治療宿主已有的對(duì)某些衣殼蛋白的免疫抗性提供了可能。
在實(shí)際應(yīng)用過程中,不同的血清型具有不同的功能用途,不同血清型對(duì)不同部位及細(xì)胞的感染效率和擴(kuò)散能力也各不相同。
那么該如何選擇合適的血清型呢?
據(jù)報(bào)道,目前適用于神經(jīng)系統(tǒng)的AAV血清型有:1、2、5、6、8、9、PHP.B、PHP.eB、PHP.S、DJ、Retro、rh10等十幾種,不同的血清型在神經(jīng)系統(tǒng)不同部位的感染效率及擴(kuò)散能力不同,合適的血清型關(guān)乎基因是否能夠?qū)崿F(xiàn)高效穩(wěn)定表達(dá),甚至關(guān)乎最終的研究結(jié)果,因此綜合標(biāo)記的細(xì)胞和每種AAV血清型的特性等因素來選擇合適的AAV血清型至關(guān)重要。
神經(jīng)元標(biāo)記示蹤工具
這類研究目的包括神經(jīng)元順行標(biāo)記和神經(jīng)元逆行標(biāo)記,此時(shí)AAV合適血清型相對(duì)單一,因此選擇起來也十分簡單。
1. 可順向跨單級(jí)突觸的血清型 — AAV1
研究報(bào)道AAV1能在高滴度條件下呈順向跨突觸傳播,與Cre依賴的報(bào)告系統(tǒng)相結(jié)合,可高效和特異性地驅(qū)動(dòng)Cre依賴的外源基因在突觸后神經(jīng)元中的表達(dá),以標(biāo)記突觸后神經(jīng)元。2020年再次深入研究了AAV1順向跨突觸標(biāo)記的作用機(jī)制——依賴于突觸囊泡的釋放,同時(shí)揭示了其在多種神經(jīng)環(huán)路中的廣泛應(yīng)用,為AAV1作為順向跨突觸示蹤病毒工具對(duì)神經(jīng)元及其投射腦區(qū)進(jìn)行標(biāo)記提供了諸多證據(jù),如圖1所示。
圖1. AAV1順向跨突觸標(biāo)記
(Zingg B et al., J Neurosci, 2020)
此外,張礪教授團(tuán)隊(duì)還證實(shí)scAAV1-hSyn-Cre相比AAV1載體具有更優(yōu)越的順向跨突觸標(biāo)記能力,可在興奮性、抑制性、神經(jīng)調(diào)質(zhì)和腦-脊髓等多種神經(jīng)環(huán)路中有效、特異地標(biāo)記單突觸靶神經(jīng)元及其輸出,從而解析不同的功能/行為。
2. 逆向標(biāo)記血清型— AAV2-retro
該載體能夠在小鼠大腦中進(jìn)行有效的神經(jīng)環(huán)路逆向標(biāo)記,且其逆行示蹤能力和效率與傳統(tǒng)的逆行示蹤劑相當(dāng)。圖2所示為rAAV2-retro的開發(fā)過程及應(yīng)用實(shí)例:
圖2. rAAV2-retro(逆向非跨突觸標(biāo)記)
(Tervo et al., Neuron, 2016)
基因操控工具
這類應(yīng)用中可供選擇的血清型較多,不同血清型的擴(kuò)散能力以及對(duì)不同部位或細(xì)胞的感染能力不同,目前常用的血清型有:1、2、5、6、8、9、rh10、DJ、hull等。在實(shí)際應(yīng)用中往往根據(jù)外周神經(jīng)、脊髓、大腦各腦區(qū)等不同部位以及細(xì)胞類型選擇合適的血清型。
外周神經(jīng)系統(tǒng)
推薦使用血清型PHP.S、rh10或9。PHP.S作為9型的改良版,不僅擴(kuò)散能力強(qiáng),而且還特異性的感染外周神經(jīng)元,是目前感染外周神經(jīng)系統(tǒng)的最佳血清型。一般情況下血清型rh10、9也能滿足實(shí)驗(yàn)需求,無論是在背根神經(jīng)節(jié)還是坐骨神經(jīng),AAVrh10和AAV9感染效率相似且顯著高于其它血清型(YannickTanguy et al. Frontiers in Molecular Neuroscience. 2015)。此外,AAVrh10在骨骼肌組織中具有感覺神經(jīng)元趨向性,非常適合用于骨痛等相關(guān)研究。
脊髓
推薦使用血清型PHP.eB、PHP.B、rh10、9。
血清型PHP. eB、PHP. B由血清型9改造,其對(duì)神經(jīng)元和膠質(zhì)細(xì)胞的感染效率達(dá)到9型的40倍以上,且通過系統(tǒng)注射即可,操作方便(圖3)。
圖3. AAV-PHP.S高效特異的感染外周神經(jīng)系統(tǒng)
此外血清型rh10或9也可以,研究人員通過髓鞘注射AAV2、5、6、8、9、rh10等六種血清型,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在脊髓背角AAV9和rh10血清型轉(zhuǎn)導(dǎo)效率最高,且對(duì)DGR的感染效率也顯著高于其它血清型(圖4),且它們作為廣譜的血清型對(duì)于其它系統(tǒng)感染效率也很高,再開展其它部位研究時(shí)不用在購買新的AAV。
圖4. 不同血清型AAV感染脊髓效果對(duì)比
大腦
相較于外周及脊髓,大腦的結(jié)構(gòu)更加復(fù)雜且分區(qū)較多,在選擇AAV血清型時(shí)要根據(jù)全腦感染還是局部感染來確定。
全腦感染
推薦使用血清型PHP.eB、PHP.B、9、rh10,這幾種血清型均能透過血腦屏障,且擴(kuò)散性很好。在對(duì)感染效率要求較高時(shí),如圖5所示,建議使用血清型PHP.eB或PHP.B;此外血清型9、rh10也可用。
圖5. AAV9、AAV-PHP.B、AAV-PHP.eB全腦感染效率對(duì)比
腦區(qū)感染
大腦不同區(qū)域因其致密程度、細(xì)胞類型等不同,所以不同腦區(qū)對(duì)應(yīng)的合適的血清型也各不相同。
紋狀體
推薦使用血清型5或DJ。已報(bào)道結(jié)果顯示在小鼠紋狀體部位注射AAV后,血清型5的擴(kuò)散范圍及感染效率最高(圖6),同時(shí)AAV5對(duì)星形膠質(zhì)細(xì)胞和神經(jīng)元感染效率高,對(duì)小膠質(zhì)細(xì)胞及少突膠質(zhì)細(xì)胞感染效率低(Dominik F et al. Plos one. 2013)。此外,血清型DJ也適合紋狀體注射,AAV-DJ對(duì)神經(jīng)元、星形膠質(zhì)細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞感染效率均較好,但不感染少突膠質(zhì)細(xì)胞(Minhee Jang et al. Front. Cell. Neurosci. 2018)。
圖6. 不同血清型AAV感染紋狀體效果對(duì)比
海馬
通常推薦使用血清型9。在海馬區(qū)域AAV9的擴(kuò)散能力及感染效率最高,通常為海馬注射AAV的首選血清型,此外血清型DJ等也可以。當(dāng)希望只感染海馬DG或CA1、CA3等區(qū)時(shí),宜選擇擴(kuò)散范圍較小的AAV2(圖7)。
圖7. 不同血清型AAV感染海馬效果對(duì)比
皮層
推薦使用血清型9或8、6、5。AAV9擴(kuò)散范圍最廣(圖8),且其感染的95%細(xì)胞為神經(jīng)元,因此在感染皮層時(shí)通常選用該血清型;血清型8或6感染效率稍低。當(dāng)感染前額葉皮層、運(yùn)動(dòng)皮層等分區(qū)時(shí),則推薦使用AAV5(Hanlim Song et al. Journal of Cerebral Blood Flow & Metabolism. 2017)。
圖8. 不同血清型AAV感染皮層效果對(duì)比
黑質(zhì)
推薦使用血清型5,與其它血清型相比其不僅在黑質(zhì)區(qū)域擴(kuò)散范圍大且感染效率高,此外其感染神經(jīng)元和膠質(zhì)細(xì)胞的效率均等(圖9)。
圖9. 不同血清型AAV感染黑質(zhì)效果對(duì)比
丘腦
推薦使用血清型5。
杏仁核
如圖10所示除血清型4、5外,其它血清型均可以,通常推薦使用血清型6或DJ。
圖10. 不同血清型對(duì)杏仁核感染效率比較
最后,如果是開展臨床試驗(yàn),推薦使用血清型2,因?yàn)槟壳爸挥醒逍?完全沒有免疫原性,最為安全,易于臨床推廣。
表1.神經(jīng)系統(tǒng)不同區(qū)域AAV血清型選擇匯總表
此外,大家還可以結(jié)合神經(jīng)系統(tǒng)特異性啟動(dòng)子,配合血清型更加高效且特異性的操控基因表達(dá)(表2)。
表2. 神經(jīng)系統(tǒng)特異性啟動(dòng)子列表
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