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五分鐘了解//自噬LC3雙標(biāo)腺病毒

時(shí)間:2024-04-22 熱度:460
Q
什么是細(xì)胞自噬?

A: 自噬是細(xì)胞內(nèi)的一種“自食(Self-eating)”的現(xiàn)象,凋亡是“自殺(Self-killing)”的現(xiàn)象,二者共用相同的刺激因素和調(diào)節(jié)蛋白,但是誘發(fā)閾值和門檻不同,如何轉(zhuǎn)換和協(xié)調(diào)目前還不清楚. 自噬是指膜(目前來源還有爭議,大部分表現(xiàn)為雙層膜,有時(shí)多層或單層)包裹部分胞質(zhì)和細(xì)胞內(nèi)需降解的細(xì)胞器、蛋白質(zhì)等形成自噬體(autophagosome),最后與溶酶體融合形成自噬溶酶體(autophagolysosome),降解其所包裹的內(nèi)容物,以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和細(xì)胞器的更新。




細(xì)胞自噬分類


目前根據(jù)發(fā)生過程分為三類:Macroautophagy,Microautophagy和Chaperone-mediated autophagy CMA)。


01

大自噬(Macroautophagy)

細(xì)胞的整個(gè)區(qū)域被包圍在雙膜小泡的自噬體中,這些自噬體然后與溶酶體融合成為自噬溶酶體,其內(nèi)容物隨后被其中的蛋白酶降解。即我們說的自噬(autophagy)

02

微自噬(Microautophagy)

是指溶酶體主動(dòng)、直接吞噬胞漿成分的一種方式。

03

分子伴侶介導(dǎo)的自噬(Chaperone-mediated autophagy,CMA)

一些分子伴侶,如hsp70,能幫助未折疊蛋白轉(zhuǎn)位入溶酶體。通常說的自噬泛指Macroautophagy。



自噬的步驟

步驟1細(xì)胞接受自噬誘導(dǎo)信號(hào)后,在胞漿的某處形成一個(gè)小的類似“脂質(zhì)體”樣的膜結(jié)構(gòu),然后不斷擴(kuò)張,但它并不呈球形,而是扁平的,就像一個(gè)由2層脂雙層組成的碗,可在電鏡下觀察到,被稱為Phagophore,是自噬發(fā)生的鐵證之一。

步驟2:Phagophore不斷延伸,將胞漿中的任何成分,包括細(xì)胞器,全部攬入“碗”中,然后“收口”,成為密閉的球狀的autophagosome,我把它翻譯為“自噬體”。電鏡下觀察到自噬體是自噬發(fā)生的鐵證之二。有2個(gè)特征:一是雙層膜,二是內(nèi)含胞漿成分,如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)碎片等。

步驟3:自噬體形成后,可與細(xì)胞內(nèi)吞的吞噬泡、吞飲泡和內(nèi)體融合(這種情況不是必然要發(fā)生的)。

步驟4:自噬體與溶酶體融合形成autolysosome,期間自噬體的內(nèi)膜被溶酶體酶降解,2者的內(nèi)容物合為一體,自噬體中的“貨物”也被降解,產(chǎn)物(氨基酸、脂肪酸等)被輸送到胞漿中,供細(xì)胞重新利用,而殘?jiān)虮慌懦黾?xì)胞外或滯留在胞漿中。


自噬的研究方法

宣尊生物已開發(fā)并完善了多套自噬相關(guān)的研究體系和工具,并積累了豐富的自噬研究經(jīng)驗(yàn)。
 

正常培養(yǎng)的細(xì)胞自噬活性很低,不適于觀察,因此,必須對(duì)自噬進(jìn)行人工干預(yù)和調(diào)節(jié),常用的工具藥有:


(一)自噬誘導(dǎo)劑
1)Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模擬內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激
2)Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化鋰):IMPase 抑制劑(即Inositol monophosphatase,肌醇單磷酸酶)
3)Earle's平衡鹽溶液:制造饑餓
4)N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制劑
5)Rapamycin:mTOR抑制劑(這是最常用的)

6)Xestospongin B/C:IP3R阻滯劑


(二)自噬抑制劑
1)3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K)hVps34 抑制劑
2)Bafilomycin A1:質(zhì)子泵抑制劑

3)Hydroxychloroquine(羥氯喹)


除了選用上述工具藥外,一般還需結(jié)合遺傳學(xué)技術(shù)對(duì)自噬相關(guān)基因進(jìn)行干預(yù):包括反義RNA干擾技術(shù)(Knockdown)、突變株篩選、外源基因?qū)氲取?/p>


細(xì)胞經(jīng)誘導(dǎo)或抑制后,需對(duì)自噬過程進(jìn)行觀察和檢測,常用的策略和技術(shù)有:
1)觀察自噬體的形成

由于自噬體屬于亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),普通光鏡下看不到,因此,直接觀察自噬體需在透射電鏡下。Phagophore的特征為:新月狀或杯狀,雙層或多層膜,有包繞胞漿成分的趨勢(shì)。自噬體(AV1)的特征為:雙層或多層膜的液泡狀結(jié)構(gòu),內(nèi)含胞漿成分,如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、核糖體等。自噬溶酶體(AV2)的特征為:單層膜,胞漿成分已降解。(autophagic vacuole,AV)


2)在熒光顯微鏡下采用GFP-LC3等融合蛋白來示蹤自噬形成:(常用)
GFP-LC3單熒光指示體系:由于電鏡耗時(shí)長,不利于監(jiān)測(Monitoring)自噬形成。我們利用LC3在自噬形成過程中發(fā)生聚集的現(xiàn)象開發(fā)出了GFP-LC3指示技術(shù):無自噬時(shí),GFP-LC3融合蛋白彌散在胞漿中;自噬形成時(shí),GFP-LC3融合蛋白轉(zhuǎn)位至自噬體膜,在熒光顯微鏡下形成多個(gè)明亮的綠色熒光斑點(diǎn),一個(gè)斑點(diǎn)相當(dāng)于一個(gè)自噬體,可以通過計(jì)數(shù)來評(píng)價(jià)自噬活性的高低。宣尊生物已開發(fā)出高效的評(píng)價(jià)用GFP-LC3病毒載體,通過瞬時(shí)高效感染細(xì)胞,配合活細(xì)胞工作站成功評(píng)價(jià)自噬流。
 
mRFP-GFP-LC3雙熒光指示體系:mRFP用于標(biāo)記及追蹤LC3,GFP的減弱可指示溶酶體與自噬小體的融合形成自噬溶酶體,即由于GFP熒光蛋白對(duì)酸性敏感,當(dāng)自噬體與溶酶體融合后GFP熒光發(fā)生淬滅,此時(shí)只能檢測到紅色熒光。
 
我們?cè)陲@微鏡成像后紅綠熒光merge后通過merge后出現(xiàn)的黃色斑點(diǎn)即只是自噬體.紅色的斑點(diǎn)指示自噬溶酶體,通過不同顏色斑點(diǎn)的計(jì)數(shù)可以清晰的看出自噬流的強(qiáng)弱.
 
如下圖:細(xì)胞轉(zhuǎn)染mRFP-GFP-LC3病毒后給予氨基酸剝奪處理2小時(shí)后出現(xiàn)明顯增強(qiáng)的自噬以及自噬流.
 
 
3)利用Western Blot檢測LC3-II/I比值的變化以評(píng)價(jià)自噬形成:
自噬形成時(shí),胞漿型LC3(即LC3-I)會(huì)酶解掉一小段多肽,轉(zhuǎn)變?yōu)椋ㄗ允审w)膜型(即LC3-II),因此,LC3-II/I比值的大小可估計(jì)自噬水平的高低。
(Note:LC3抗體對(duì)LC3-II有更高的親和力,會(huì)造成假陽性。方法2和3需結(jié)合使用,同時(shí)需考慮溶酶體活性的影響。)
 

4) 利用Western Blot檢測p62蛋白來評(píng)價(jià)自噬以及自噬流的強(qiáng)弱:

起初自噬所降解的底物被認(rèn)為是隨機(jī)的,但是后來的研究表明有些蛋白是seletively降解的,在這些蛋白之中研究的最為透徹的是蛋白p62,p62 is selectively incorporated into autophagosomes through direct binding to LC3 and is efficiently degraded by autophagy ; thus, the total cellular expression levels of p62 inversely correlate with autophagic activity. (一般情況下p62蛋白水平的多少與自噬流的強(qiáng)弱有著反比例關(guān)系)



END

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