基因干擾
RNA干擾(RNA interference,縮寫為RNAi)是指一種分子生物學(xué)上由雙鏈RNA誘發(fā)的基因沉默現(xiàn)象,其機(jī)制是通過阻礙特定基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯來抑制基因表達(dá)。當(dāng)細(xì)胞中導(dǎo)入與內(nèi)源性mRNA編碼區(qū)同源的雙鏈RNA時(shí),該mRNA發(fā)生降解而導(dǎo)致基因表達(dá)沉默。如圖1。
由于RNAi具有高度的序列專一性,可以特異地沉默基因,從而獲得基因功能喪失或基因表達(dá)量的降低。因此可以作為功能基因組學(xué)研究的一種強(qiáng)有力的工具。在實(shí)際應(yīng)用中,通過病毒載體表達(dá)小核RNA(snRNA)進(jìn)行RNAi已經(jīng)非常成熟,能夠有效、快捷和持久地干擾體內(nèi)基因的表達(dá)。廣泛應(yīng)用到基因功能研究,藥物靶點(diǎn)篩選,細(xì)胞信號傳導(dǎo)通路分析和疾病治療等方向。
圖1. RNAi示意圖(圖源:Majumdar Rajtilak, et al., Frontiers in Plant Science , 2017)
應(yīng)用范圍
1.基因功能研究:RNAi具有高效特異性抑制基因表達(dá)的特點(diǎn),運(yùn)用病毒載體介導(dǎo)shRNA干擾可以調(diào)控基因表達(dá),進(jìn)而研究基因功能;
2.信號通路研究:可以運(yùn)用該技術(shù)進(jìn)行體內(nèi)體外相關(guān)信號通路及作用機(jī)制的研究;
3.構(gòu)建疾病模型:通過病毒載體介導(dǎo)shRNA干擾可構(gòu)建轉(zhuǎn)基因抑制小鼠模型;
4.基因治療:RNAi被用于基因表達(dá)異常升高引起的疾病,如:腫瘤和病毒感染等;
5.藥物開發(fā):利用RNAi特異性高效地抑制基因的表達(dá),獲得基因功能抑制表型,進(jìn)而大規(guī)模地篩選出基因靶點(diǎn),從而實(shí)現(xiàn)短時(shí)間內(nèi)藥靶在細(xì)胞水平和動物水平的篩選和評定。
RNAi三類載體的特點(diǎn)以及適應(yīng)性
1.直接表達(dá)shRNA。以AAV病毒載體為例:由III型啟動子(U6或H1)直接啟動shRNA表達(dá),表達(dá)能力強(qiáng),表達(dá)范圍廣,適合廣譜性表達(dá)。
舉例,rAAV-直接表達(dá)shRNA載體關(guān)鍵元件:
2.Cre依賴shRNA。以AAV病毒載體為例:由Cre重組酶調(diào)控III型啟動子(U6或H1)啟動shRNA表達(dá),表達(dá)特異性由Cre的表達(dá)調(diào)控,因此需要與Cre病毒或Cre小鼠一起使用,具有表達(dá)特異和受Cre表達(dá)調(diào)控的優(yōu)勢,但其工作效率受Cre表達(dá)強(qiáng)弱的影響。
舉例,rAAV-Cre依賴shRNA表達(dá)載體關(guān)鍵元件:
3 . miRNA依賴的shRNA。以AAV病毒載體為例:由II型啟動子啟動以miRNA為骨架表達(dá)shRNA的系統(tǒng),表達(dá)能力強(qiáng)并且干擾效果好,可以利用II型啟動子的特異性促使shRNA特異性表達(dá)。
舉例,rAAV-miRNA依賴shRNA表達(dá)載體關(guān)鍵元件:
現(xiàn)有載體列表(部分)
服務(wù)流程
案例展示
1.Lewandowski等人用AAV介導(dǎo)表達(dá)shRNA抑制成年大鼠的PTEN的表達(dá),導(dǎo)致核糖體蛋白pS6磷酸化增加。
圖3. 成年大鼠皮質(zhì)內(nèi)注射AAV抑制PTEN的表達(dá)。(Lewandowski, et al., Journal of Neuroscience, 2014) 2.Saal等人用AAV表達(dá)shRNA抑制ROCK2的表達(dá),可減輕多巴胺能神經(jīng)元在毒素誘導(dǎo)的帕金森病模型中的退變。
圖4. AAV介導(dǎo)的shRNA體外特異性抑制ROCK2表達(dá)(Saal, et al., Neurobiology of Disease, 2015)